申辦 HACCP 認證的第4個步驟，必須為每個產品繪製一張製造流程圖（flowchart）。這張製造流程圖必須涵蓋整體製程，從原料接收到產品裝運出廠，任何一個步驟通通都要畫進來。包括產品的前處理、加工、包裝、貯藏和裝運等與產品加工有關的所有環節，產品的各工序之間的停留時間、描述產品加工手續、技術操作、品質要求等的附加說明等。從原料接收到產品裝運出廠，包括前後端製程通通都要把流程畫出來。前端處理製程包括原物料領料驗收、配方設計、例如過篩。而後端處理製程例如伴料烘烤、放涼、金屬檢驗、包裝…等。HACCP在建立製造流程圖這階段有一個重點，那就是一開始畫流程圖的時候，要把每一個製程步驟羅列的越詳細越好。這是因為下一個階段就進入到進行HACCP的重要步驟─危害分析（Conduct a hazard analysis）。在危害分析的步驟中，必須從這張流程圖去挑出關鍵製程。倘若製造流程圖的步驟寫的太簡略，則有可能會漏掉重要的危害性分析步驟，導致整個HACCP導入失敗。而且，即使製造流程圖後來發現某些程序是多餘，到時候視情況要再刪掉即可。流程圖畫好出以後，要拿到生產線現場，和實際操作人員再次確認，這個流程圖是和真正的製造過程相符或避免遺漏製程。